Descrição
Descrição:
A eletroforese de ácidos nucléicos é comumente realizada em géis de poliacrilamida em concentrações que variam entre 4 – 20%. Assim, os géis de poliacrilamida são comumente utilizados como matriz para separação eletroforética de ácidos nucléicos e de proteínas. A formação desta matriz (gel de poliacrilamida) é dependente da co-polimerização dos radicais livres da acrilamida e ligadores, chamados, cross-linkers como a N,N-methylene-bis-acrylamide (Bis-acrilamida).
A proporção entre acrilamida e bis-acrilamida determina o tamanho do poro do gel, que se deseja utilizar, o que em última instância idealmente, separa as moléculas aplicadas (p.e. proteínas são geralmente separadas utilizando proporções entre 29:1 até 37,5:1, entanto que um raio de 19:1 é comumente utilizado para seqüenciamento de DNA ou para separação de proteínas).
Quanto maior o tamanho dos pares de bases a ser separados, maior o tamanho do poro necessário, conseqüentemente menor a porcentagem de Acrilamida a ser utilizada. Para eletroforese de DNA ou RNA fita simples, tradicionalmente AcriGel 19:1 é utilizado juntamente com porcentagens de uréia nos géis. A solução pronta-para-uso Acrigel 29:1 é utilizada para formular géis nativos, que não contem uréia, para a eletroforese de ácidos nucléicos fita dupla.
